В древние времена, Милос процветал благодаря его полезным ископаемым.Остров был населен с эпохи неолита (7000 до н.э.), и вскоре процветал за счет соседних островов, благодаря обсидиану, черному вулканическому камню, который использовали для создания оружия и инструментов. Считается, что камень добывали и для экспортной торговли, так как Милосский обсидиан находили на Пелопоннесе, Крите, Кипре и даже Египте.С раннего бронзового века (2800 – 1100 до н.э.), остров играет очень важную роль в мире Кикладских островов, с эпицентром городом Филакопии, который дал свое имя целому археологическому периоду. После пришествия греческих племен, Дорийцы поселились на Милосе около 1000 г. до н.э.. В этот же период Милоссы начинают строить, в районе нынешнего Клима, новый город.
Очень мало известно из древних источников об острове Милос до 5 века до н.э. Тем не менее, мы знаем что жители Милоса были теми, кто отказал Персам в “земле и воде” и воевали вместе с другими греками в битвах при Саламине и Платеях. А также были разгромлены в 415 г. до н.э. Афинянами, когда пытались сохранить нейтралитет в Пелопоннесской войне.В последующие века Милос следует судьбе других Кикладских островов. До 311 г. до н.э. остров принадлежит Македонии, а затем Египту. Свобода и безопасность на море, благодаря мощному флоту Птолемеев, дают возможность для нового экономического развития острова, что также способствовало расцвету искусств.Знаменитая статуя Венеры (Лувр) и грандиозный Посейдон, высотой 2,50 м. (Археологический музей Афин) являются характерными примерами этого нового процветания. Во времена Римской эпохи Милос украшается и другими проектами (мраморный театр), в то время появляется и христианство, вероятно с 1-го века. Неопровержимыми свидетелями являются катакомбы, крупнейшие в Греции и среди одни из самых замечательных в мире. В византийские времена самое главное событие, это конечно разрушение древнего города Клима (5-6 в.), скорей всего из-за землетрясений.
Наконец, во время Венецианского правления, Османской и Германской оккупации, борьба Милосов за свободу была постоянной и безжалостной.